viernes may 28, 2010

UGRGrid: Un gran centro de supercomputación científica

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Hace unos días he tenido la oportunidad de visitar el CPD que alberga el primer nodo de la Red Andaluza de Supercomputación Científica que fue creada el 28 de diciembre de 2006 por iniciativa de la Junta de Andalucía, la Universidad de Granada (UGR) y Sun Microsystems.

Se constituyó entonces la sección de Supercomputación de la Universidad de Granada, donde se ubicaron los primeros nodos de la red. Esta instalación que lleva el nombre de UGRGrid, pasó un test de rendimiento Linpack para su acreditación a nivel mundial, obteniendo en la medida Sum Rmax 4.222 GFlops y 5.491 GFlops en Sum Rpeak, lo que lo colocó en la posición 469 a nivel mundial en la lista Top500 de junio de 2007.

Actualmente se dispone de dos tipos de arquitecturas de cálculo, una de memoria distribuida y otra de memoria compartida. La de memoria distribuida se llama UGRGrid y dispone de una arquitectura basada en un Cluster Sun Fire X2200 M2/X4600 M2 con 1.264 núcleos, un total de 3 TByte de memoria RAM y 24 TByte de almacenamiento, interconectado todo ello a través de una red Infiniband de alto rendimiento. Este sistema utiliza los servicios de backup generales de la Universidad.

Pieza clave de la solución es el sistema de ficheros compartido Lustre, que ofrece la capacidad de obtener un importante ancho de banda agregado y que ofrece una estabilidad y escalabilidad muy altas, lo que resulta fundamental para garantizar unos altos niveles de prestaciones y servicio, siendo considerado por los gestores del centro una de las claves del éxito del mismo. Lustre es un producto open source que está siendo reforzado por la compra de Sun por Oracle.

Y esto me lleva a la razón de dedicar esta entrada: el servicio que se ofrece. Desde el día 1 de octubre de 2009, los recursos computacionales de UGRGrid se ofrecen a todos los investigadores del Plan Andaluz de Investigación (PAI). El servicio está en pleno funcionamiento y con una madurez y eficiencia palpables. 

El número de CPD científicos no es muy alto y tradicionalmente se asume que el investigador usuario es un consumidor de recursos que ha de tener un buen conocimiento informático. Aquí el UGRGrid piensa que el usuario ha de centrarse en la investigación y no en la informática y se ofrece una serie de servicios de herramientas tipo y apoyos a la optimización de los programas privados del investigador para aprovechar al máximo las capacidades del sistema. Y estos servicios se ofrecen a través de un portal con acceso ergonómico y en el que el usuario autorizado carga el trabajo mediante un menú amigable y es informado de su estado de proceso y de su finalización.

A eso hay que añadir que la gestión está muy depurada, con sofisticadas herramientas de control y monitorización que permiten mantener un alto nivel de ocupación de recursos. El sistema de acceso a recursos es básicamente un sistema de mercado entre oferta y demanda, lo que implica que cuanto menor sea la cantidad de recursos solicitados más rápido será el acceso y viceversa, aunque también hay cabida para la reserva de recursos para grandes proyectos que, en circunstancias normales tendrían muy difícil su asignación de recursos.

La experiencia demuestra un alto nivel de disponibilidad y una explotación cuidada que, por ejemplo, tiene programada una parada para una actualización de la versión de Lustre a 1.8, una vez realizadas las pruebas previas con absoluto éxito. En suma, como persona de Sun me siento orgulloso de la tecnología, pero sobre todo de ver lo bien que se usa y de que la tecnología funciona tan bien que las preocupaciones de sus responsables están en los niveles de servicio y en la satisfacción de sus usuarios, que actualmente son 48 grupos de investigación del PAI. Detalles sobre la producción científica aquí.

Y como tema curioso, a las puertas del UGRGrid hay una pieza de museo: un lector de tarjetas perforadas Univac de los años 70 del pasado siglo. Un maridaje de lo antiguo y lo nuevo.

Para algunos proyectos en que se necesita memoria compartida, en otro centro del mismo edificio está Mulhacén, un servidor SGI de arquitectura Numa con 64 procesadores y 64 GByte de memoria RAM.

viernes oct 09, 2009

Foro Técnico Informática de la Salud: Proyectos Multidisciplinares

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Cerró la segunda jornada del Foro Técnico de Informática de la Salud una mesa redonda sobre proyectos multidisciplinares, moderada por Guillermo Vázquez, Subdirector de SI del Hospital Universitario de A Coruña (antes el Juan Canalejo). Su departamento ha generado 6 proyectos de investigación de los que lideran directamente tres y en los otros tres han cedido el liderazgo a grupos clínicos pero manteniendo la propiedad intelectual, lo que demuestra que la colaboración multidisciplinar con otros profesionales sanitarios es posible.

Guillermo mantiene que se pueden liderar proyectos sin complejos y va más allá afirmando que los Servicios de Sistemas de Información Sanitarios deben de ser un instrumento clave en el cambio de una medicina basada en el fracaso a una medicina mucho más proactiva en mantener la salud.

Raimundo Lozano, del H. Clinic de Barcelona, trabaja dando consultoría y soporte de SI a los muchos proyectos de investigación de su hospital. Explicó como cuando los servicios de TIC colaboran estrechamente desde las desde la gestación de los proyectos se puede facilitar el éxito de los mismos y la optimización de recursos de SI globales del hospital.

La heterogeneidad y complejidad de los proyectos es enorme y la participación de expertos informáticos en todas las fases es necesaria para lograr una eficiente gestión de los recursos y del tiempo. Propugna que los cpd sanitarios debieran de estar diseñados no sólo para la gestión y la práctica asistencial, sino también para la investigación.

Juan Fernando Muñoz, del Ministerio de Sanidad y Política Social y miembro del comité ejecutivo del proyecto europeo epSOS para la interoperabilidad de historias clínicas resumidas y recetas electrónicas, nos ilustró sobre su alcance, gestación y complejidad para cumplir los retos de interoperabilidad, semánticos, de organización y legales.

Destacó que la presencia española es totalmente multidisciplinar, incluyendo clínicos, documentalistas sanitarios, clínicos evaluadores, informáticos, ingenieros, asesores legales.... No es fácil, pero es posible.

Olaia Vázquez, del Instituto de Investigación Médica de La Coruña, explicó las diversas fuentes de financiación privada y pública, bien a nivel autonómico, nacional e internacional, resaltando que España dedica un 1,05% del PIB a investigación frente al 2% de la media europea y las incertidumbres para el 2010 en el que no parece que se vaya a lograr ni mucho menos el 12,5% de aumento planificado en su día. La crisis puede provocar incluso un descenso.

Miguel Prados de Reyes, del H. Clínico San Cecilio, defendió el papel de los servicios de informática como propulsores de la investigación y la innovación y evitar perder su potencial restringiendo su trabajo a la mera función de mantener los SI operativos. Se unió a los que demuestran que es posible y puso como ejemplo que entre sus objetivos anuales está el presentar al menos un proyecto a una convocatoria de financiación.

Y presentó una estrategia para facilitar la financiación de la investigación e innovación que recomendó a los colegas, consistente en incorporar una cláusula de I+D+i y de formación científica en los contratos de servicios, con su correspondiente baremación para la adjudicación. Y, más aún, intentar firmar acuerdos de I+D+i con las empresas.

Carlos Parra, del H. Universitario Virgen del Rocío, se planteó si el I+D+i de los servicios de informática aportaba o no valor a los Servicios de Salud. Mediante una metodología parecida a la de un proyecto de investigación desarrolló un proceso en el que se estudiaban diferentes variables, principalmente el aumento de financiación para el servicio de IS, el número de innovaciones asumidas por el centro y el número de grupos clínicos de investigación con los que se estaba asociado en los proyectos.

La conclusión era que se acelera la innovación y se mejora la percepción del valor de la informática a nivel asistencial y gerencial. Unas consideraciones importantes son que se ha de contar sólo con aquellos profesionales del servicio que se sientan apasionados ante la oportunidad de investigar y evitar aquellas empresas que vean en ello sólo la oportunidad para pagar las nóminas a final de mes.

En la clausura se manifestó el compromiso de avanzar y en el próximo año no sólo debatir sino elaborar unas conclusiones, lo que, aun siendo lo lógico, no deja de ser sorprendente por lo inhabitual.






lunes mar 30, 2009

European Eduacation & Research Conference 2009

El EERC 2009, que estrenaba formato europeo, ha reunido a unas 150 personas del la comunidad educativa y de investigación, incluyendo usuarios finales de TIC en estos contextos, partners de Sun con soluciones de alto valor añadido, expertos de Sun y la innovadora participación de cinco "campus ambassadors" de Sun en distintas universidades europeas. Esta figura de promotores de comunidades Sun en las universidades se está consolidando como un muy interesante vivero de potenciación de la innovación y ha sido gratamente sorprendente ver lo que están haciendo y promoviendo.

Tres jornadas intensas y apretadas jornadas con un adecuado balance entre presentación de novedades de Sun, de algunos partners y de proyectos reales de nuestros clientes a las que me voy a referir aquí de forma somera. En unos días haré una entrada nueva con la dirección para acceder al repositorio de presentaciones.

Tras una introducción en la que los ejecutivos de Sun glosaron la visión y propuestas clave de Sun, con especial énfasis en el software libre y comunidades como motor de innovación y el peso de estas tecnologías en el cloud computing, destaco de la primera jornada la presentación sobre la apuesta por las memorias de estado sólido por parte de Sun apoyada sobre la premiada tecnología ZFS que permite empezar a hablar de RAIM (Redundant Array of Inexpensive flash Memory) como una evolución del concepto RAID. Peter Tandy, llegó a presentar un avance de un blade de almacenamiento con 2TB con esta tecnología.

El Prof. Alexander Reinefeld del Zuse-Institute de Berlín, presentó Scalaris, un modelo de almacenamiento distribuido orientado a la web2.0 que definió como escalable, transaccional, con claves distribuidas, con datos replicados en memoria y fuerte consistencia. Con una arquitectura en tres capas (transacción, replicación y P2P) remito al lector al este enlace para conocer el tema, que parece muy interesante.

Steve Heller, Director de SunLabs, presentó el abanico de soluciones en las que trabaja su grupo para preparar soluciones a las necesidades computacionales de los próximos años. Para mi lo más sorprendente fue el diseño de circuitería con comunicación inalámbrica por enfrentamiento parcial de chips que promete un paso más en la miniaturización de sistemas. ¿Un supercomputador en una placa?.

El segundo día se abrió con un par de sesiones sobre HPC. De la presentación de Marc Hamilton, destaco el esfuerzo de Sun en buscar soluciones eco-eficientes. El avance de de las TIC hace necesario un replanteamiento del consumo energético no ya desde el punto de vista del TCO de los sistemas sino del propio planeta. El CPD en un contenedor que aloja los 3 PetaByetes del Archivo de Internet, proyecto que aloja el histórico de Internet y otros contenidos digitales, es un claro ejemplo. También lo será el reciente anuncio del futuro supercomputador del BOM (Bureau of Meteorology of Australia).

El Dr. Helge Meinhard, del CERN dio una auténtica conferencia para legos sobre física cuántica y el Gran Colisionador de Hadrones (LHC). Sun está presente en el CERN con sus grandes librerías SL8500 que permiten manejar los 15PBytes/año que allí se generan.

Hubo cuatro sesiones paralelas. Yo estuve en la de Aulas con Realidad Mixta. Me siento incapaz de resumir tanto bueno en este espacio. Lo dejo en que los desarrollos basados en Wonderland se están consolidando en auténticas experiencias educativas de nueva generación. Por ejemplo, el St. Paul College, crea un nuevo mundo virtual en 72 horas. Sugiero entrar en CATTID de la U. Roma, MIRTLE y GuintiLabs.

De la intensa jornada de tarde destaco a Kaj Arnö, que explicó el valor de las comunidades y la imparable marcha de MySQL, con 70.000 descargas diarias. Comentó que allá donde va no tiene que hablar de sus ventajas, sino del valor de los servicios de suscripción. Morten Kristoffer del Ministerio e Ciencia de Dinamarca, habló del uso del software libre, citando un completo marco de e-facturación como ejemplo. NextGate, partner de Sun, presentó sus desarrollos sobre la plataforma Mural, con diferentes usos de soluciones MDM para solucionar la consistencia de identificaciones de alumnos, pacientes, ciudadanos, productos, etc, de especial relevancia cara al proceso de gestión curricular de Bolonia.

Y, finalmente, en la sesión del tercer día, fue muy interesante conocer los enormes avances que se están produciendo y continuarán en los próximos meses sobre la familia de soluciones de virtualización y en especial sobre la virtualización del puesto de trabajo, en las que la conjunción de Sun Ray, Virtual BOX, VDI y XVM u otros virtualizadores, van a revolucionar el panorama del puesto de trabajo, no solo desde el punto de vista funcional, sino de TCO y de eco-responsabilidad.

Lynne Tucker presentó su ejemplo de despliegue de VDI para virtalizar el puesto de trabajo de los alumnos, tanto en el campus del King's College de Londres como en sus casas. Bo Norregaard, del Maersk Mc-Kinney Moller Institute de Dinamarca presentó el proyecto ECOSOC, en donde la innovación en software básico ayuda a desarrollos de soluciones de eco-sostenibilidad, en este caso el proyecto de gestión inteligente de energía.

No quiero acabar sin mencionar la presencia en el pabellón de partners de la cmpañía española Infoes, que presentó iniciativas superinnovadoras para HPC con la tecnología Sun CMT usando lenguajes funcionales (por ejemplo Erlang), en lo que ellos llaman HPC de gama media, permitiendo un modelo científico con base en HPC para instituciones o departamentos con presupuestos moderados.

En fin, una Conferencia con mucho contenido, utilidad y contactos personales muy útiles que recomiendo para futuras ediciones.









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Mi punto de vista desde mi posición en Oracle.

Los puntos de vista de este blog son míos y no necesariamente reflejan los de Oracle.

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